L'incidenza di infezioni della ferita chirurgica diminuisce con la somministrazione di antibiotici prima dell'incisione cutanea.
Il tipo di procedura influenza le scelte specifiche.
La maggior parte dei casi richiede la copertura della flora cutanea (Staphylococcus e Streptococcus), solitamente con una cefalosporina di prima generazione.
Anche la chirurgia intestinale richiede la copertura contro la flora anaerobica e Gram-negativa. Una cefalosporina di seconda generazione appropriata soddisfa questo requisito.
Il ruolo della profilassi antibiotica per interventi chirurgici puliti che non prevedono l'impianto di materiale protesico rimane controverso.
Il loro utilizzo dipende solitamente dal parere del chirurgo