1. Articolazioni: l'artrite periferica è parallela all'attivitá della malattia intestinale;
spondilite anchilosante e sacroiliite (associata a HLA-B27)é indipendente dall'attività della malattia intestinale
2. Cute: eritema nodoso, ulcere aftose, pioderma gangrenoso, malattia celiaca cutanea
3. Occhi: congiuntivite, episclerite, irite, uveite
4. Fegato: fegato grasso, “pericolangite” (colangite sclerosante intraepatica), colangite sclerosante primitiva, colangiocarcinoma, epatite cronica
5. Altre: anemia emolitica autoimmune, flebite, embolo polmonare (stato di ipercoagulabilitá), calcoli renali, malattia ossea metabolica